Fluorestsents olukorra hübridiseerimisel

Fluorestsents in situ hübridisatsioon (FISH) on geneetiline sõelumismeetod DNA (desoksüribonukleiinhape) üksikute rakkude tuumades.

See meetod hõlmab spetsiifiliste DNA sondide kasutamist, mis võivad anda teavet ainult nende genoomsete piirkondade kohta, mille jaoks kasutatav sond on spetsiifiline.

Näidustused (kasutusvaldkonnad)

  • Arvulise kromosomaalse kõrvalekalde kahtlus:
    • Numbriliste kromosomaalsete kõrvalekallete tuvastamine (nt trisoomia 21).
    • Kromosomaalsete aberratsioonide mosaiikide kvantifitseerimiseks (nt UllrichTurneri sündroom).
  • Mikrodeletsioonide tuvastamine (nt monosoomia 22q11.2).
  • Kromosoomide kõrvalekallete tuvastamine (nt krooniline lümfotsütaarne leukeemia (CLL), mitte-Hodgkin lümfoom).

Eespool toodud näidustusi analüüsitakse faasidevahelise FISH-iga (vt üksikasju laboratoorsete protseduuride kohta).

Protseduur

Vajalik materjal

  • Hepariini veri (vähemalt 1-2 ml)

Patsiendi ettevalmistamine

  • Pole vajalik

Häirivad tegurid

  • Pole teada

Labori meetod

Fluorestsents in situ hübridisatsioon (FISH) hõlmab fluorestsentsmärgistatud DNA sondide (FISH sondid) kasutamist. Need võivad seonduda kromosoomi kindla DNA saidiga, mida nimetatakse hübridisatsiooniks. Fluorestseeruvalt märgistatud sondi sidumisel või pärast seda saab hindamise teostada mikroskoobi abil. Selles protsessis määratakse fluorestsentssignaalide arv faaside vahelistes tuumades. Lisaks hinnatakse metafaasis asukohta (nt translokatsiooni / asukoha nihet / teise kromosoomi) kromosoomid on võimalik.

Kui erinevad fluorestseeruvad värvained kasutatakse FISH-i protseduuris erinevate siht-DNA-de jaoks, seda nimetatakse mitmevärviliseks FISH-ks. See võimaldab genoomi täielikult visualiseerida.

Mõnel juhul ei ole DNA sondi otseselt märgistatud fluorestsentsvärviga, mida nimetatakse kaudseks protseduuriks. Selle asemel on see märgistatud selliste ainetega nagu biotiin või digoksigeniin. Seda meetodit peetakse keerulisemaks, kuid see on tundlikum.