Endokriinsed, toitumis- ja ainevahetushaigused (E00-E90).
- Keskne türeoidiit (kilpnäärme põletik).
- Struma nodosa (nodulaarne struuma)
- Türeoidiit (kilpnäärmepõletik)
Neoplasmid - kasvajahaigused (C00-D48)
- Follikulaarsed adenoomid (healoomuline kasvaja, mis pärineb folliikulist epiteel).
- Follikulaarne kilpnäärmevähk (umbes 30%).
- Lümfoom
- Medullaarne kilpnäärmevähk (C-rakuline kartsinoom; umbes 5%).
- Kilpnäärme papillaarne kartsinoom (umbes 60%).
- Diferentseerimata (anaplastiline) kilpnäärme kartsinoom (umbes 5%).
- Haruldased vormid, näiteks pahaloomulised lümfoom või sarkoom.
- Metastaasid teistest kasvajatest
- Kilpnäärme adenoom - healoomuline kasvaja kilpnääre.
- Kapseldatud kilpnäärme kartsinoomi kapseldatud follikulaarne variant (EFVPTC); mitteinvasiivse follikulaarse kilpnäärme neoplasmaga ja papillaarsete tuumarakkudega (NIFTP) patsientidel on halva tulemuse oht väga madal. st kilpnäärme lobektoomia (ühe kilpnäärme kahest lobast täielik eemaldamine) on siin tavaliselt piisav
- Tsüstid kilpnääre, kõrvalkilpnääre või ductus thyreoglossus.